José Refugio Rodríguez, uno de los letrados del capo, dijo en Radio Fórmula que la petición de su cliente fue hecha "en un acto de desesperación".
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El abogado dijo que buscarán negociar con Estados Unidos una pena baja y que esté en una cárcel de mediana seguridad.
La defensa y la pareja de Guzmán, considerado líder del cartel de Sinaloa, han dicho que las autoridades no lo dejan dormir y que su salud está en riesgo, aunque el gobierno sostiene que no se violan sus derechos humanos.
Guzmán fue recapturado en enero y enviado al penal de máxima seguridad del Altiplano, del cual se había escapado en julio de 2015 a través de un túnel.
Desde su recaptura las autoridades han dicho que tomaron nuevas medidas, como cambiarlo de celda constantemente y mantener guardias frente a su calabozo con cámaras en un casco.
Rodríguez dio hace unos días a The Associated Press un testimonio judicial de Guzmán, quien dijo sentirse como "sonámbulo".